Фамилия Никулышева — женская форма фамилии Никулышев, и её разговорный, нестандартный суффикс сразу выбивается из ряда привычных «Никулиных» и «Николаевых». Если бы предка звали просто Никула, он стал бы Никулиным. Но здесь работает суффикс -ыш-(-ышев), который в русских фамилиях встречается редко и несёт особый смысл.

В основе фамилии лежит имя Никула — народная, усечённая форма канонического имени Николай. В русских говорах такие сокращения были обычны: Микула, Никула, Микола. Однако суффикс -ыш- в фамилиях обычно указывает на уменьшительно-ласкательное или, реже, пренебрежительное отношение. Например, в парах «сын — сынишка», «вор — воришка». В ономастике есть фамилии Малыш, Голыш, Дурнышев — они произошли от прозвищ, где -ыш- подчёркивал характерный признак. В случае с Никулышевым мы видим ту же модель: не просто Никула, а Никулыш — «маленький Никула» или «Никула-сын». Вероятно, так в семье или в деревне называли младшего из нескольких Никул, чтобы отличить его от отца или деда.

Географически фамилия Никулышев тяготеет к северным и центральным регионам России, особенно к Вологодской, Архангельской и Костромской областям. Именно в этих краях были живы диалектные формы имени Николай (Никула, Микула) и охотно использовались прозвищные суффиксы. Встречаемость фамилии невысокая — это не массовая фамилия, а локальная, что подтверждает её «домашнее» происхождение: прозвище Никулыш могло закрепиться за конкретным родом в одной деревне и дальше не распространиться.

С социальной точки зрения носители фамилии Никулышевы, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Дворянские роды с таким окончанием почти не встречаются — слишком просторечная основа. Фамилия образовалась не в канцелярии, а в живой речи: сначала человека звали Никулыш (внутри семьи), потом его дети стали Никулышевыми, и прозвище превратилось в наследственное имя.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Никулышев стоит особняком. Никулин — самая частая форма, она нейтральная и образована по продуктивной модели. Никулаев — редкая, но тоже прозрачная. А Никулышев — самая «разговорная» и конкретная: она сохранила не только имя, но и отношение к человеку, его место в семейной иерархии.