Фамилия Нинов образована от личного имени Нино, но вот что за именование легло в основу — здесь есть две версии, и обе имеют право на существование. Первая и наиболее вероятная: Нино — это болгарская уменьшительная форма имени Николай. В переводе с греческого оно означает «победитель народов», и в этом случае фамилия Нинов входит в огромное семейство «николаевских» фамилий, таких как Николаев, Никулин, Никольский. По второй версии, имя Нино могло быть формой женского крестильного имени Нина. Толкований у этого имени несколько: «ласковая», «госпожа» или «царица», а также «юность». Покровительница имени — Святая Нина, просветительница Грузии. С её именем связана история исцеления грузинской царицы Наны, которая после чуда из идолопоклонницы стала ревностной христианкой. Её супруг, царь Мириан (265–342), под влиянием язычников готов был подвергнуть святую мучениям, но в тот момент, когда вымышляли казнь, померкло солнце и мгла покрыла место, где находился царь. Царь ослеп, а его свита тщетно умоляла идолов Армаза, Задена, Гаима и Гаци вернуть свет — они были глухи, и мрак лишь усиливался. Тогда устрашённые единогласно воззвали к Богу, которого проповедовала Нина, и мрак мгновенно рассеялся. Это событие совершилось 6 мая 319 года.

Если отталкиваться от мужской версии происхождения, то фамилия Нинов — типичная отчество на -ов, то есть «сын Нино». Такая модель характерна для русских фамилий, но сама основа указывает на болгарское или южнославянское влияние, что делает фамилию заметной на фоне более привычных русских образований. Интересно, что в русской традиции имя Нино почти не встречалось как самостоятельное мужское, поэтому фамилия могла закрепиться за потомками выходцев с Балкан или, что тоже вероятно, за человеком, которого в быту звали уменьшительным Нино от Николая, не задумываясь о его происхождении. Менее правдоподобная версия с женским именем Нина предполагает, что фамилию могли дать по матери, но для патронимических фамилий это скорее исключение, чем правило, поэтому основной гипотезой остаётся связь с Николаем. Как бы то ни было, потомок человека по имени Нино со временем получил фамилию Нинов, и сегодня она звучит редко, но сохраняет память о своём тёзке — святом Николае или святой Нине, в зависимости от того, какой путь выбрали предки.