Фамилия Нисанова — женская форма фамилии Нисанов, и её происхождение почти наверняка связано с еврейской традицией именования. Основа фамилии — личное имя Нисан. В еврейском календаре Нисан — первый месяц библейского года (приходится на март–апрель), и имя, данное мальчику, родившемуся в этом месяце, было распространено среди ашкеназских и бухарских евреев. Таким образом, фамилия Нисанов буквально означает «потомок (или сын) Нисана».

Модель образования здесь проста и прозрачна: к основе имени Нисан добавили русский патронимический суффикс -ов, который в среде еврейского населения Российской империи в XIX веке стал стандартным способом оформления фамилий. Суффикс -а в окончании указывает на то, что носительница — женщина. В отличие, скажем, от фамилии Нисанский, которая могла бы указывать на географическую привязку (например, к местечку с похожим названием), Нисанов — чисто отчество, «чей сын?».

Интересная деталь: фамилия Нисанов (и Нисанова) встречается преимущественно в среде горских и бухарских евреев, а также у ашкеназов. У бухарских евреев имя Нисан и производные от него фамилии особенно часты, так как в их культуре сохранилась традиция называть детей в честь праздников и месяцев еврейского календаря. В метрических книгах и списках избирателей конца XIX — начала XX века фамилия Нисанова фиксируется в Тифлисе, Баку, Самарканде и некоторых городах черты оседлости, что подтверждает её восточно-еврейский ареал.

Спорных версий у фамилии практически нет. Единственная альтернатива — возможная связь с тюркским или арабским корнем «нисан» (значение «знак», «метка»), но для русскоязычной фамилии это маловероятно: имя Нисан как антропоним в тюркских языках почти не встречается, а у евреев оно задокументировано столетиями. Поэтому версия с еврейским календарём — основная и единственная правдоподобная.