Фамилия Нишанбаева ведет свое начало от мусульманского мужского прозвища Нишанбай, которое, в свою очередь, состоит из двух частей. Первая из них восходит к арабскому мужскому имени Нишан, которое переводится на русский язык как «знак, метка, тавро, след», «знак отличия, орден». Синонимичными именами являются Рамиз, Рамзи. Второй компонент имени – бай – в переводе с тюркского языка означает «хозяин; богатый, состоятельный господин, влиятельный, могущественный человек». Таким образом, род Нишанбаевых ведет свое начало влиятельного, богатого, прославленного бая, возможно имевшего какие-то знаки отличия. Процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения рода Нишанбаевых можно лишь на основании генеалогических исследований.