Фамилия Ножинская — женская форма от Ножинский, и её разумнее всего разбирать в мужском варианте, поскольку именно он указывает на родоначальника. Перед нами типичная фамилия польского или западнорусского происхождения, образованная по модели с суффиксом -ский/-цкий. В отличие от простых русских фамилий на -ов, такие фамилии в XVI–XVII веках чаще всего носили представители шляхты или духовенства, а позже — выходцы из этих сословий, перебравшиеся в центральную Россию.

Корень «Ножин» почти наверняка восходит к прозвищу Нож или Ножка. В словаре древнерусских прозвищ Веселовского встречаются «Нож» и «Ножик» — так могли назвать человека, промышлявшего изготовлением ножей, либо просто обладателя длинного носа (в говорах «ножка» — уменьшительное от «нос»). Есть и вторая, менее вероятная версия: от гидронима Ножа — реки в бассейне Западной Двины. Если предок жил на берегу такой реки, его могли записать как «Ножинский» — по владению землёй у реки Ножи. Но прозвищное происхождение встречается чаще.

Географически фамилия Ножинские тяготеет к западным губерниям Российской империи: Могилёвской, Витебской, Гродненской. Встречается и на Украине, но реже. В польской ономастике есть фамилия Nóżiński с тем же корнем, что подтверждает связь со шляхетской средой. В XIX веке носители фамилии фиксируются среди мещан и однодворцев — потомков служилых людей, которые после разделов Речи Посполитой оказались в составе России.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Ножинская. Вариант с ударением на первый слог встречается, но он менее характерен для фамилий на -ский, которые в русском языке обычно сохраняют ударение основы. Если ваши предки происходят из Беларуси или западных областей России, фамилия почти наверняка указывает на ремесленника-ножевика или на человека с характерной внешностью — длинным или острым носом.