Фамилия Оксанишина — редкий случай, когда женская форма закрепилась в качестве общей для семьи. В русской традиции фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а/-я: Оксана → Оксанин, а далее по законам словообразования появляется суффикс -иш-, который придаёт оттенок принадлежности или, в некоторых говорах, увеличительности. Получается, что Оксанишина — это буквально «жена или дочь того, кто связан с Оксаной», но с необычным суффиксом, который встречается нечасто.

Основа фамилии — женское имя Оксана, украинский вариант канонического имени Ксения. В народной этимологии Оксану часто связывали с «оксанит» (так в некоторых говорах называли щавель или кислую траву), но это позднее переосмысление. На самом деле имя восходит к греческому «ксенос» — «гостья, чужестранка». В украинской среде имя было распространено шире, чем в великорусских губерниях, поэтому фамилия Оксанишина явно указывает на южнорусское или украинское происхождение рода.

Суффикс -ишин (в женской форме -ишина) типичен для фамилий, образованных от имён или прозвищ с окончанием на согласный или -а: ср. Фомишин, Кузьмишин, Ильишин. Но в случае Оксанишина мы видим двойную обработку: сначала от имени Оксана сделали притяжательное прилагательное Оксанин, а затем к нему добавили -иш- для уточнения. Встречается и вариант Оксанишин (мужская форма), но в быту фамилия чаще фиксируется в женском роде — это могло произойти, если в семье долгое время не было мужчин-наследников или фамилию записали со слов вдовы.

Географически фамилия тяготеет к Черниговской, Полтавской и Харьковской областям, а также к смежным районам России, куда переселялись украинские крестьяне. В дореволюционных метрических книгах Оксанишины встречаются среди мещан и казаков — то есть не были ни крепостными, ни дворянами, а относились к свободным сословиям, что подтверждает народный характер фамилии.

Есть и более прозаичная версия: в некоторых говорах слово «оксаниться» означало «киснуть, скисать» (от того же «оксан» — щавель). Тогда прозвище Оксаниша могли дать человеку с кислым выражением лица или любителю щавеля. Но эта гипотеза слабее — имя Оксана как основа встречается в документах гораздо чаще, чем подобные прозвища. Так что предок носителей фамилии, скорее всего, был просто сыном или внуком женщины по имени Оксана, а необычная форма закрепилась благодаря местному говору и особенностям записи.