Фамилия Онопенко звучит на украинский лад, и это сразу подсказывает, где искать её корни. Перед нами типичная патронимическая фамилия, то есть образованная от личного имени отца. Разбираем её по косточкам: основа «Оноп» — это одна из народных, разговорных форм церковного имени Онуфрий. Суффикс «-енко» в украинской традиции как раз и означает «сын», «потомок», поэтому буквально Онопенко — «сын Онопа». Проще говоря, так в старину говорили про ребёнка, отец которого носил имя Онуфрий.

Имя Онуфрий пришло на Русь вместе с христианством из греческого языка, а греки, в свою очередь, позаимствовали его из древнееврейского. В переводе с иврита оно означает «священный бык» или «посвящённый Богу». Имя это прославил преподобный Онуфрий Великий, египетский пустынник IV века, который провёл в полном одиночестве шестьдесят лет. На Руси имя полюбилось, но в быту его часто перекраивали на свой лад, сокращая до простых и удобных форм — Онуфрей, Оношко, Оноп, Оноха. Именно от формы Оноп и пошла фамилия Онопенко.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна. Суффикс «-енко» — один из самых распространённых в украинской ономастике. Изначально он указывал на прямое родство, а к XVI–XVII векам закрепился как полноценный фамильный суффикс, особенно в Поднепровье, на Слобожанщине и в Запорожье. Поэтому Онопенко — фамилия с ярко выраженным украинским колоритом, хотя её носители вполне могли жить и на юге России, куда украинские переселенцы приносили свои фамилии.

Интересно, что фамилия эта — редкий гость в ономастических словарях. У неё нет громкой истории, вписанной в дворянские родословные книги, и нет известных на всю страну носителей, которых можно было бы привести в пример. Зато она прекрасно иллюстрирует живой процесс народного словообразования: длинное церковное имя сократили до трёх букв, а потом добавили суффикс родства. Так из пышного Онуфрия получился простой и крепкий Онопенко — «сын Онопа», человек, чьи предки носили имя, означающее «священный бык».