Основой фамилии Оверко послужило имя Оверка. Однако в некоторых местностях Аверьян – это искаженная форма имени Валериан (в переводе с латинского – «здоровый, сильный»). Под влиянием северных «окающих» говоров имя Аверьян стало произноситься как Оверьян. Эта форма и послужила основой для фамилии. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Оверка, со временем получил фамилию Оверко.