Фамилия Падынич звучит для русского уха нестандартно, и это прямо указывает на её происхождение. Суффикс -ич — верный признак белорусской или западнорусской модели образования фамилий. В Великом княжестве Литовском, а затем и в Речи Посполитой, суффикс -ич (-ович, -евич) был основным патронимическим формантом, то есть указывал на происхождение от отца: Падынич буквально означает «сын Падына» или «потомок Падына».

Самая сложная часть — корень «Падын-». Скорее всего, это не полное христианское имя, а прозвище, которое со временем стало именем. Можно искать основу в диалектных словах. В некоторых русских говорах «падым» или «падынь» — это падаль, дохлятина. Прозвище Падыня могли дать человеку, который занимался уборкой павшего скота, или, в переносном смысле, неряшливому, опустившемуся человеку. Звучит грубо, но ономастика часто работает с такими реалиями. Более мягкая версия — связь с глаголом «падать»: прозвище мог получить неуклюжий, часто спотыкающийся человек.

Вряд ли фамилия происходит от географического названия — топонимов с корнем «Падын-» на картах Восточной Европы не зафиксировано. Встречается она в основном на территории современной Беларуси и в приграничных областях России (Смоленщина, Брянщина), что подтверждает её западнорусские корни. Социальный состав носителей, судя по архивным данным XIX века, — преимущественно крестьяне и мещане, что типично для фамилий на -ич, которые в Российской империи не были привилегией шляхты, а бытовали во всех сословиях.