Фамилия Пакишев — один из тех случаев, когда этимология лежит на поверхности, но не спешит открываться. На первый взгляд, в ней слышится что-то восточное, тюркское, и это ощущение не обманывает. Основа «Пакиш» — это, вероятнее всего, вариант тюркского имени или прозвища, образованного от слова «бакыш» (bakış) — «взгляд, вид» или «пак» — «чистый, святой». В тюркских языках, особенно в казахском и татарском, «бакыш» может означать «взгляд», а в переносном смысле — «зоркий, внимательный» или даже «ясновидящий». Звуковой переход «б» в «п» в русской записи — явление частое, особенно в фамилиях, записанных на слух.

Модель образования фамилии проста и типична для русской ономастики: суффикс -ев присоединён к основе Пакиш. Это указывает на то, что фамилия формировалась как отчество или прозвище рода: «чей?» — «Пакишев», то есть сын или потомок человека по прозвищу Пакиш. В русских говорах, особенно в северных и уральских, суффикс -ев часто закреплялся за основами, оканчивающимися на шипящий или мягкий согласный, что и произошло здесь.

Географически фамилия Пакишев не слишком распространена, но встречается в Поволжье, на Урале и в Сибири — как раз в зонах активного контакта русского и тюркского населения. Это наводит на мысль о смешанном происхождении: предок мог быть крещёным татарином, башкиром или казахом, получившим фамилию по прозвищу, данному за остроту зрения или необычную внешность. Вторая, более редкая версия, отсылает к диалектному русскому слову «пакиш» — так в некоторых говорах называли небольшой мешок, котомку. В этом случае прозвище мог получить странник или нищий, носивший с собой пожитки.

В любом случае, фамилия Пакишев — не из числа древних княжеских или боярских родов. Она скорее крестьянская или мещанская, возникшая не раньше XVII–XVIII веков, когда массово закреплялись фамилии у податных сословий. Её носители, скорее всего, были людьми практичными: землепашцами, ремесленниками или служилыми людьми на окраинах государства. Сегодня фамилия остаётся редкой, что делает её особенно ценной для генеалогического поиска — каждый Пакишев может проследить свою ветвь без путаницы с однофамильцами.