Фамилия Палагушина — женская форма фамилии Палагушин. В основе лежит прозвище или неканоническое имя Палагуша, которое, скорее всего, связано с диалектным глаголом «палагушить». В некоторых южнорусских и украинских говорах это слово означало «праздно болтать, пустословить, говорить вздор». Так могли прозвать болтливого человека, любителя поболтать без дела.

Модель образования типична для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность «чей?» — сын или дочь Палагуши. Сама основа Палагуш- образована с помощью уменьшительного суффикса -уш- от корня палаг-, который восходит, вероятно, к «палагуз» или «палагуда» — словам, означающим «пустомеля» или «нескладный человек». Аналогичные фамилии — Балагушин (от «балагур»), Пустословов.

Встречается редкий вариант с написанием через «о» — Пологушин, что может указывать на акающее произношение в южных регионах. Географически фамилия Палагушина зафиксирована в основном в центральных и южных областях России (Тамбовская, Воронежская, Ростовская области), а также на Украине, что подтверждает её южнорусские корни.

В некоторых случаях нельзя исключать версию происхождения от имени Палагея (народная форма Пелагеи) с переходом «г» в «г» и суффиксом -уш-: Палагуша как ласкательное имя. Но эта гипотеза менее вероятна: для фамилий от канонических имён чаще встречается суффикс -ин к полной основе (Палагеин), а уменьшительная форма Палагуша дала бы фамилию Палагушин лишь при условии, что прозвище уже вытеснило имя.

Сословной принадлежности предков по фамилии однозначно не определить: носителями могли быть и крестьяне, и мещане. В документах XVIII–XIX веков крестьяне с такой фамилией встречаются в Тамбовской губернии. Вероятно, предок Палагушиных был человеком заметным в своей среде — не тем, кто молчит, а тем, кто говорит много и громко.