Фамилия Паначева (и её вариант Паначёва) — это отчество второго порядка, которое напрямую отвечает на вопрос, чьим потомком был первый носитель: Паначев — сын Панача, внук Пани. За этим коротким именем, ставшим основой фамилии, скрывается сразу несколько возможных историй, и ономасты предлагают разные версии его происхождения.

Самая распространённая версия связывает имя Паня с церковным именем Апполинарий, которое восходит к древнеримскому Аполлинарий — «принадлежащий Аполлону». Имя было труднопроизносимым для простого человека, поэтому в быту оно упростилось до короткой формы Паня. Чередование гласных О/А в корне (Апполинарий — Паначев) объясняется «акающим» русским литературным произношением, когда безударный звук [о] звучит как [а]. Скорее всего, основатель рода был человеком из простого сословия — в крестьянской и мещанской среде такие сокращённые формы церковных имён были обычным делом.

Однако имя Паня могло быть производным и от других крестильных имён, например от греческого Пантелеймон («всемилостивый») или Панкратий («всемогущий»). В этом случае фамилия также оказывается связана с православным календарём, но выбор конкретного имени-основы уже не столь очевиден.

Отдельная ветвь версий отталкивается не от имени, а от прозвища Панач. Здесь исследователи обращают внимание на диалектное слово «панич» — так называли молодого неженатого барина, а также поляка или выходца из западнорусских земель. Если прозвище Панач имело такое значение, оно указывало либо на социальное положение предка, либо на его этническую принадлежность. Менее вероятной, но любопытной выглядит связь со словом «панок» — свинцовая палка, бита. Такое прозвище могло относиться к «профессиональным» именованиям и указывать на род занятий, например на кузнеца, работавшего с этим инструментом.

Отдельного внимания заслуживает суффикс -ач, который выделяет эту фамилию из ряда типичных русских отчеств на -ов/-ев. Он указывает на возможное украинское или белорусское происхождение, где такие формы были более распространены. Это делает фамилию Паначева ценным источником семейной истории: передаваясь из поколения в поколение, она сохранила память о том, как далёкий предок сокращал своё имя или какое прозвище получил от окружающих.