Фамилия Панчишных — яркий пример севернорусского типа фамилий, образованных по модели «-их» / «-ых». В отличие от центральной России с её суффиксами -ов и -ин, на Русском Севере (Архангельская, Вологодская, Вятская губернии) закрепилась форма родительного падежа множественного числа: «из дома Панчишных», то есть из семьи Панчишных. Со временем это окончание застыло и стало неизменяемой фамилией.

В основе фамилии лежит прозвище или неканоническое имя Панчиш. Это уменьшительная форма от Панча, а Панча, в свою очередь, — вариант имени Пантелеймон или Панкратий. В народном произношении Пантелеймон часто сокращали до Паня, Панча, Панчиш. Суффикс -иш- в имени Панчиш характерен для разговорной речи: он придаёт уменьшительно-ласкательный или пренебрежительный оттенок (сравните: Ваня — Ваниш, Петя — Петиш). Таким образом, Панчиш — это «маленький Паня» или «Паня, которого ласково зовут».

Вероятность того, что фамилия происходит от названия профессии или предмета, мала. Слово «панчиш» не фиксируется в словарях русских ремёсел или бытовой лексики, а попытки связать его с «панч» (удар) или «панч» (напиток) — натяжка: эти заимствования пришли в русский язык слишком поздно и не могли стать основой для прозвища в крестьянской среде.

Носители фамилии Панчишных — это потомки крестьян или посадских людей из северных регионов России. Фамилия недворянская, не относится к аристократическим, но именно такие «северные» фамилии на -их и -ых наиболее устойчиво сохраняют память о родовом гнезде. Если ваши предки носили эту фамилию, скорее всего, они жили в Архангельской или Вологодской губернии, а родоначальником был человек по имени Пантелеймон, которого в быту звали Панчиш.