Фамилия Панпушин — редкий случай, когда за основу взято не имя и не профессия, а, скорее всего, прозвище, образованное от сложного слова. Разбирая её по составу, видим корень «пан» и корень «пуш». Первая часть, «пан», в русских фамилиях часто указывает на польское или западнорусское происхождение: паном называли помещика, господина, вообще человека знатного или свободного. Вторая часть, «пуш», может восходить к глаголу «пушить» — делать пушистым, взбивать, или к существительному «пух». Получается, что Панпушин — это «панов пух» или «пушистый пан». Вряд ли речь шла о буквальной пушистости: скорее, так могли в шутку прозвать человека, который носил пышную, пушистую одежду, например, шапку или воротник, подражая панской моде, но не имея на это настоящего права. Прозвище могло закрепиться за крестьянином или мещанином, который любил принарядиться «по-пански», или за тем, кто торговал пухом и пером и при этом держался важно.

Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Панпушин — сын Панпуши. Сама фамилия образована по стандартной русской модели, хотя основа звучит необычно. Встречаются родственные фамилии: Панпулов (с тюркским суффиксом), Панпушкин. Однако Панпушин — самая распространённая форма, хотя и она крайне редка. По данным современных телефонных справочников, основная масса носителей живёт на юге России, в Краснодарском крае и Ростовской области, а также на Украине. Это косвенно подтверждает западнорусскую или украинскую природу корня «пан»: в тех краях слово было в ходу, и прозвища с «паном» встречались чаще, чем на севере или в Сибири. В дореволюционных источниках фамилия почти не фиксируется, что говорит о её позднем оформлении — вероятно, в XIX веке, когда крестьяне массово получали фамилии по прозвищам. Сословно предки Панпушина были, скорее всего, государственными или помещичьими крестьянами, а само прозвище — бытовой насмешкой над манерой одеваться или держаться.