Основой фамилии Паньшин послужило имя Паньша. Согласно другой, более правдоподобной гипотезе, в основе фамилии лежит имя Паньша – уменьшительная форма имен Пантелеймон, Панкратий, Панфил. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Паньша, со временем получил фамилию Паньшин.