Фамилия Панышева образована от прозвища или имени Паныш, и у её происхождения есть две основные версии. Первая связывает основу с польским словом «пан» — «господин». В южнорусских говорах паном называли барина или боярина, а в украинском языке «паныч» означает «сын господина». В некоторых губерниях прозвание «пан» закреплялось за потомками поляков, переселенных вглубь России во время войн с Польшей. Поэтому прозвище Паныш могло указывать либо на национальность предка, либо на его высокое социальное положение.

Согласно второй гипотезе, Паныш — это производная форма имени Панас, которое в западных районах Украины и Белоруссии служило вариантом крестильного имени Афанасий. В переводе с греческого оно означает «бессмертие». Эта версия правдоподобна, поскольку уменьшительные формы имен часто становились основой для фамилий, а имя Панас было широко распространено именно в тех краях.

Первое документальное упоминание именования Паныш относится к середине XVI века: в «Ономастиконе» С. Веселовского записан новгородский крестьянин Паныш, 1545 года. В ревизских сказках 1795 года уже встречаются Панышевы дети. Суффикс -ев указывает на притяжательное значение: фамилия отвечала на вопрос «чей?» и означала «сын Паныша». Так прозвище или некалендарное имя закрепилось за человеком, а затем перешло к его потомкам уже в форме фамилии.

Что интересно, в фамилии Панышева соединились две разные традиции именования — польско-украинская, связанная со словом «пан», и православная, идущая от имени Афанасий. Какая из них верна для конкретного рода, без генеалогических изысканий сказать сложно, но обе версии имеют право на существование и отражают сложные культурные связи между славянскими народами.