Фамилия Панюков относится к типу русских фамилий, образованных от личного имени. В её основе лежит имя Панюк — одна из народных, «домашних» форм крестильного имени Павел, которое в переводе с латинского означает «маленький», «малый». Цепочка преобразований выглядит так: Павел — Паня — Панюк. Суффикс -юк в данном случае выступает как уменьшительно-ласкательный, а фамильный суффикс -ов добавляет значение принадлежности: Панюков значит «сын Панюка», «потомок Панюка».

Стоит оговориться, что имя Панюк могло быть и самостоятельным производным от других греческих имён, начинающихся на «Пан-»: Пантелеймон («всемилостивый»), Панкрат («всемогущий») или Панфил («всеми любимый»). В просторечии эти длинные имена нередко сокращались до одного слога, и форма Панюк вполне могла закрепиться за носителем любого из них. Однако версия с именем Павел выглядит предпочтительнее: она проще и не требует дополнительных допущений, поскольку форма Паня традиционно считается именно производной от Павла.

География бытования фамилии широка, что говорит о её давнем распространении. В Книге памяти Республики Коми упоминаются Алексей Семенович Панюков, родившийся в 1911 году в селе Керос Сторожевского района Коми АССР, и Андрей Яковлевич Панюков, родившийся в 1897 году в селе Сторожевск. В Книге памяти Иркутской области записан Анисим Федорович Панюков, родившийся в 1887 году в деревне 2-я Лимонова Курской губернии. Эти записи — не просто перечень имён, а важное свидетельство: они показывают, что к началу XX века фамилия уже бытовала и на Русском Севере, и в чернозёмных губерниях, и в Сибири, куда её принесли переселенцы.

Интересно, что фамилия сохранила следы диалектного произношения имени. Форма Панюк, а не более привычное Павлович или Павлов, закрепилась в тех регионах, где были распространены краткие обиходные варианты имён. Поэтому Панюков — это не столько указание на конкретное имя предка, сколько отпечаток живой разговорной традиции, в которой церковное имя перекраивалось на домашний лад. По сути, каждый Панюков — потомок человека, которого в быту звали просто Паня или Панюк, и эта фамилия стала семейным напоминанием о том, как звучало это имя в повседневной речи.