Фамилия Панюкова — женская форма фамилии Панюков, а та, в свою очередь, произошла от личного имени или прозвища Панюк. Перед нами классическая русская модель: к основе, оканчивающейся на согласный, добавили суффикс -ов, который указывал на принадлежность. То есть изначально Панюков — это «сын Панюка», а Панюкова — «дочь (или жена) Панюкова». В старину такое отчество закреплялось за детьми и передавалось дальше, постепенно превращаясь в родовое имя.

Само имя Панюк — это уменьшительная, обиходная форма. Чаще всего его связывают с именем Павел. В переводе с латыни Paulus значит «маленький», и на русской почве это имя дало множество производных: Паша, Павлуша, а в некоторых говорах — Паня и Панюк. Так что вполне вероятно, что родоначальник Панюковых носил крестильное имя Павел, но в быту его звали сокращённо.

Однако народная этимология не ограничивается одним вариантом. Панюк могло быть просторечной формой и других календарных имён: Пантелеймон (от греческого «всемилостивый»), Панкрат («всемогущий») или Панфил («всеми любимый»). Все они начинаются с «Пан-», и в разговорной речи окончание легко усекалось до короткого и удобного «Панюк». Выбрать единственный источник сложно: в разных семьях, независимо друг от друга, к одному и тому же прозвищу могли прийти от разных имён.

Интересно, что фамилия с таким корнем не единственная. Рядом стоят Панютин, Панюшин, Паньков — все они выросли из похожих уменьшительных форм. Это говорит о том, что имя было живым и распространённым, особенно в северных и центральных русских говорах, где любили усекать имена до одного-двух слогов.

Судя по модели образования, носители фамилии не принадлежали к знати. Фамилии на -ов у простых людей, крестьян и посадских, закрепились позже, чем у дворян, — в основном в XVI–XVII веках. Поэтому Панюков — это фамилия человека из простого сословия, возможно, крестьянина или ремесленника, которого в документах записали по имени отца: «Панюков сын». Со временем указание на родство отпало, и осталась фамилия, которая сегодня звучит как Панюкова у женщин и Панюков у мужчин.