Фамилия Панюшенко образована от имени Панюша. В свою очередь, Панюша — это просторечный вариант крестильного имени Павел (в переводе с латинского «маленький») или одного из греческих имен, начинающихся на Пан-: Панайот (переводится как «всесвятой»), Панкрат («всемогущий»), Пантелеймон («всемилостивый»), Панфил («всеми любимый») и т.п. Существует и другая версия происхождения фамилии Панюшенко — от прозвища Панюша, которое связано с нарицательным «пан». Панами в старину называли потомков поляков, переселенных в глубь дореволюционной России во время войн с Польшей. Иногда панами называли также состоятельных или гордых людей. Таким образом, потомок человека, которого звали Панюша, со временем получил фамилию Панюшенко. Так, в Книге памяти Ставропольского края записан украинец Панюшенко Федосей Захарович, который родился в 1875 году (Киевская губ., с. Покотилово).