Основой фамилии Панюшев послужило мирское имя Панюша. Так в старину называли потомков поляков, переселенных вглубь дореволюционной России во время войн с Польшей. Однако согласно другой, более правдоподобной гипотезе, в основе этой фамилии лежит имя Панюша – уменьшительная форма имен Пантелеймон, Панкратий, Панфил и некоторых других. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Панюша, со временем получил фамилию Панюшев.