Фамилия Папандин — одна из тех, где сразу бросается в глаза необычный финал. Суффикс -ин обычно указывает на принадлежность: «чей?» — папандин, то есть сын или слуга человека по прозвищу Папанда. Но вот что скрывается за этим прозвищем — вопрос поинтереснее.

Самая вероятная версия отсылает к южнорусским говорам, где слово «папанда» или «папандя» могло означать неуклюжего, неповоротливого человека, увальня. В диалектах Воронежской, Ростовской областей встречается глагол «папандить» — идти медленно, вразвалку, тяжело переставляя ноги. Прозвище давали не в обиду, а как бытовую характеристику: «Эх ты, папанда этакий». Корень здесь, скорее всего, звукоподражательный: тяжелые шаги («пап-пап») плюс экспрессивный суффикс -анд(а), который встречается в просторечных словах (ср. «шаланда», «куланда»).

Менее правдоподобная, но упоминаемая в любительских словарях версия — связь с тюркским «папан» (дед, предок) или «баба» (отец). Слабость этой гипотезы в том, что суффикс -дин для тюркских заимствований в русских фамилиях нехарактерен: обычно тюркские основы дают фамилии на -ов (-ев) или -ин, но в виде «Папанов», а не «Папандин». Если бы корень был восточным, мы бы скорее увидели форму Папандов или Папандиев.

Географически фамилия редкая и точечная. Основной ареал — юг России (Краснодарский край, Ростовская область) и Украина (Донецкая, Луганская области). Встречается у казачьих родов, что косвенно подтверждает диалектное происхождение: донские и кубанские говоры богаты на такие экспрессивные прозвища.

С точки зрения словообразования фамилия архаична: модель «прозвище на -а + -ин» типична для XVI–XVII веков, когда фиксировали не по отцу, а по индивидуальной черте. Носитель фамилии Папандин — потомок человека, которого в округе знали как Папанду, то есть медлительного, основательного, возможно, грузного мужчину. Никакой связи с «папой» или «паном» здесь нет, несмотря на внешнее сходство.