Фамилия Парахотя — редкая и с точки зрения современного языка неочевидная. Её основа, скорее всего, восходит к глаголу «парахотеть» или существительному «парахоть». В русских говорах, особенно южнорусских и украинских, «парахоть» — это пыль, мельчайшая труха, сор, а также переносно — легкомысленный, несерьёзный человек, «пыль в глаза пускающий». Таким образом, прозвище Парахотя могли дать либо неряхе, от которого вечно летит труха, либо человеку ветреному, непостоянному.

Словообразовательная модель здесь нестандартная. Фамилия оформлена окончанием -я, что для русских фамилий нетипично: обычно это черта украинских или белорусских фамилий (сравните: Парахотя, Гуляйполе, Непийвода). Иными словами, Парахотя — это не русифицированная форма, а застывшее прозвище в именительном падеже, которое так и закрепилось. Суффикса -ов/-ин нет, что говорит о более позднем или диалектном происхождении, либо о том, что фамилия возникла на территории, где такие «голые» формы были нормой.

Версия о связи с греческим именем Параскева (Параша) маловероятна: для этого фамилия должна была бы звучать как Парахин или Парашев. Звук «х» в середине указывает именно на глагольный или диалектный корень.

Географически фамилия Парахотя встречается в основном на юге России и в восточной Украине, что подтверждает её связь с местными говорами. В исторических документах фамилия не частотна, поэтому точных сведений о сословной принадлежности первых носителей нет: это могли быть как крестьяне, так и казаки. Единственное, что можно сказать с уверенностью: предок носителя фамилии получил прозвище за характер или внешний вид, а не за профессию.