Фамилия Парфени — редкий случай, когда фамилия сохранила почти нетронутой свою первоначальную форму. Вопреки ожиданиям, это не типичная русская фамилия с суффиксом -ов или -ин, а застывшая основа имени. Её образовали напрямую от канонического имени Парфений, которое пришло на Русь вместе с христианством из греческого языка и означает «целомудренный, чистый, нетронутый».

Обычно от таких имён в русской среде появлялись формы Парфенов, Парфентьев или Парфенин. Здесь же мы видим архаичный, «необработанный» вариант, который чаще встречается в среде греческого духовенства или в тех регионах, где ощущалось сильное влияние греческой книжной традиции. Такая форма могла закрепиться за человеком, который был тесно связан с церковью, либо за выходцем из семьи, где имя не переделывали на русский лад, а произносили близко к оригиналу.

Церковный контекст здесь не случаен. Одним из покровителей имени считается святой мученик Парфений Константинопольский, который управлял византийской церковью в 1656–1657 годах. Его почитание было широко распространено в православном мире, и наречение ребёнка в честь такого святого считалось почётным. Поэтому предок, носивший имя Парфений, с высокой вероятностью происходил из набожной семьи, а возможно, и сам принадлежал к духовному сословию — в среде священников и монахов как раз и было принято сохранять точное звучание имён.