Фамилия Пасеин — редкий случай, когда внешне простая форма скрывает неочевидную основу. На первый взгляд, перед нами типичная «патронимическая» модель с суффиксом -ин (отвечает на вопрос «чей?»), указывающая на происхождение от отца или предка по имени или прозвищу. Но именно с корнем «пас-» начинаются сложности.

Самая прямая версия — связь с пчеловодством. В южнорусских и украинских говорах «пасéка» — место, где стоят ульи, а «пасéчник» (или «пасéин», в диалектном произношении) — пчеловод. Если предок держал пасеку, его могли прозвать Пасея, а его детей — Пасеиными. Однако суффикс -еин (не -еев) в этой фамилии настораживает: обычно от «пасека» образуется Пасеков или Пасечников. Форма Пасеин скорее от личного имени или прозвища, а не от названия места.

Вторая, более убедительная версия — от канонического имени Паисий (греч. «дитя» или «играющий»). В народном произношении имя нередко звучало как «Пасий» или «Пасея», а отчество от него — «Пасеин сын», то есть Пасеин. Имя Паисий было распространено среди духовенства и крестьян центральных губерний, поэтому фамилия могла закрепиться в среде, где грамотность и церковная традиция были в почёте.

Третья, маловероятная, но любопытная возможность — связь с глаголом «пасти» (пастух). В этом случае прозвище Пасея дали бы человеку, который пас скот. Но обычно пастушьи фамилии образуются через суффиксы -ух, -ухов (Пастухов) или -арь (Пастушенко), а форма Пасеин для этого нехарактерна.

Географически фамилия встречается точечно, без ярко выраженного «гнезда». По данным открытых источников, носители Пасеина живут в центральной России и Поволжье — это косвенно подтверждает версию о происхождении от имени Паисий, так как именно там имя было популярно в XVII–XVIII веках.

Таким образом, скорее всего, Пасеин — это «сын Пасеи», то есть Паисия. Фамилия не массовая, не дворянская, а скорее крестьянская или мещанская, возникшая в среде, где имя предка запомнили в его обиходной, «опрощенной» форме.