Фамилия Пелепейкина хранит память о предке, которого в быту звали Пелепейка. Это имя — не самостоятельное, а народная, разговорная форма церковного имени Филипп. Само имя Филипп пришло из греческого языка, где слово philippos складывается из двух основ: «филео» — люблю, и «гиппос» — лошадь. То есть буквально Филипп — это «любитель лошадей». Имя было широко распространено на Руси, и в каждой местности его перекраивали на свой лад: где-то говорили Филипок, где-то Филимон, а где-то — Пелепей. От этой просторечной формы и пошла фамилия.

Покровителей у этого имени несколько. В православной традиции почитают святого апостола Филиппа, одного из двенадцати учеников Христа, а также святого мученика Филиппа Апамейского. Отдельно стоит упомянуть преподобного Филиппа Иранского, жившего в XV–XVI веках. Он прославился кротостью и трудолюбием, был пострижен в иночество и удостоен священного сана, а позже основал пустынь. Житие этого святого — редкий случай, когда мы можем предположить, что имя Филипп в простонародной форме Пелепейка было особенно почитаемо в тех краях, откуда пошел род.

Сам способ образования фамилии типичен для русской ономастики: к основе Пелепейка добавили притяжательный суффикс -ин, который указывает на принадлежность. Первоначально Пелепейкин означало «сын Пелепейки», «тот, кто из семьи Пелепейки». Такая модель чаще всего встречалась в среде крестьян и посадских людей, поэтому можно с уверенностью сказать: основатель рода Пелепейкиных был выходцем из простого сословия, а не из дворян. Фамилия закрепилась за потомками и со временем перестала быть простым указанием на отца, став родовым именем.