Фамилия Перех — редкий пример фамилии, образованной не от полного имени или профессии, а от глагольной основы, причём в повелительном наклонении. В русской ономастике такие фамилии называют «императивными»: они произошли от прозвищ, которые были командами или пожеланиями. Слово «перех» — это форма повелительного наклонения от глагола «переть» (идти, двигаться, наступать). Прозвище Перех могли дать человеку настойчивому, упрямому, который «прёт» напролом, или же, в ироничном смысле, медлительному, кого постоянно подгоняли: «Перех!».

Суффикс в фамилии отсутствует — это так называемая «нулевая» модель. В русских фамилиях она встречается редко, чаще у украинцев и белорусов (например, Гриб, Коваль). У русских такие фамилии обычно фиксировались на юге, в казачьих областях, или в среде однодворцев. Поэтому Перех — скорее всего, фамилия из южнорусских или украинских земель, где прозвища в чистом виде без суффиксов становились фамилиями.

Есть и вторая, менее вероятная версия: фамилия могла возникнуть от диалектного слова «перех» — так в некоторых говорах называли перекладину, поперечный брус. Тогда прозвище относилось к человеку плотного телосложения или к мастеру, делавшему такие перекладины. Но эта гипотеза слабее: в словарях такое слово не зафиксировано как распространённое, а глагольное происхождение для фамилий типичнее.

Фамилия Перех не имеет «дворянского» суффикса -ский или -ов, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение носителей. В дореволюционных переписях она встречается крайне редко, в основном на территории современной Украины (Полтавская, Черниговская губернии) и в южных уездах России. Сегодня Перех — фамилия немногочисленная, но её простота и необычная модель делают её заметной среди типовых русских фамилий.