Фамилия Пересековы хранит память о прозвище дальнего предка, и расшифровать её можно двояко. В основе лежит глагол «пересекать» или «пересечь», поэтому первая и самая вероятная версия — прозвище Пересек для человека, который перебрался на новое место, «пересёк» землю или границу. Так на Руси нередко называли переселенцев, и фамилия в этом случае отвечала на вопрос «чей вы?» — сын, внук или потомок Пересека.

Вторая версия связана с диалектным словом «пересек» — так в некоторых областях называли расчищенный под пашню участок леса, а также межу или границу между полями. Тогда прозвище мог получить земледелец, живший у такого рубежа или владевший таким наделом. Обе трактовки укладываются в крестьянский и земледельческий быт, что делает фамилию самобытным памятником славянской культуры, а её носителя — обладателем ценного источника семейной истории.

Словообразовательная модель проста и прозрачна: основа «пересек» плюс типичный русский суффикс принадлежности -ов. По такой же схеме строятся тысячи русских фамилий от прозвищ и имён, и подобные именования широко представлены в ономастике восточных, западных и южных славян. Суффикс -ов указывает на патронимический характер фамилии: первоначально она означала «сын Пересека» и лишь потом закрепилась как наследственная.

Интересно, что фамилия могла возникнуть независимо в разных регионах: там, где активно шло освоение новых земель, и там, где существовал диалектный термин «пересек». Процесс формирования каждой отдельной фамилии был длительным и не всегда имел привязку только к одной местности, поэтому окончательно говорить о точном времени и месте происхождения фамилии Пересеков можно лишь на основании серьёзных генеалогических исследований.

Среди однокоренных фамилий встречаются Пересекин, Пересецкий, а также более редкие варианты с ударением на второй слог — Пересёков. Такое расхождение в написании и произношении — обычное дело для фамилий, записанных в разных губерниях писарями на слух. Сама фамилия не относится к дворянским или именитым, но именно в этом её ценность: она сохранила бытовое прозвище простого человека, чья жизнь была связана с землёй и дорогами.