Фамилия Перлинский — одна из тех, где за привычным суффиксом скрывается неочевидная основа. Если не копать, можно решить, что корень тут «перл» (жемчуг) и перед нами фамилия, связанная с торговлей жемчугом или ювелирным делом. Но это лишь одна из версий, и не самая частая.

По модели образования фамилия — типично польская или западнорусская (с территории бывшей Речи Посполитой). Суффикс -ский указывал на принадлежность к месту или на дворянское происхождение. Чаще всего такие фамилии давались по названию имения, деревни или урочища. И действительно, на карте Польши, Беларуси и Западной Украины есть несколько населённых пунктов с корнем «Перл» или «Перлин» — например, деревня Перлины (Perlin) в Мазовецком воеводстве или Перлин в Литве. Выходец из такого места получал прозвище «Перлинский», то есть «тот, кто из Перлина». Это самая прямая и географическая версия.

Вторая версия — от прозвища Перло, Перля. В старину «перлом» могли назвать не только жемчуг, но и нечто ценное, красивое, или же, наоборот, с иронией — щеголя, франта. Прозвище могло прилипнуть к человеку из-за его характера или внешности. От него через патронимический суффикс возникла фамилия Перлин, а уже от неё — «выездная» форма Перлинский, которую брали, например, при поступлении в духовное училище или при переходе в другое сословие. Такое «удлинение» фамилии было типично для семинаристов: они часто переделывали простые фамилии в более благозвучные на -ский.

Третья, менее вероятная, но возможная версия — от еврейского имени или прозвища. В идише «перл» означает «жемчужина» и часто входит в состав женских имён (Перл, Перла). Фамилия Перлинский могла возникнуть в среде еврейского населения черты оседлости как матронимическая (по матери) или как искусственная, «красивая» фамилия, которую давали раввины или канцеляристы.

Таким образом, носитель фамилии Перлинский мог быть потомком шляхтича из имения Перлин, крестьянина, которого прозвали за щегольство, или же выходцем из еврейской местечковой семьи. Выбрать одну версию без генеалогического исследования невозможно, но географическое происхождение — самое распространённое объяснение для фамилий на -ский в этом регионе.