Фамилия Персинин — одна из тех, что образованы от прозвища или имени, которое сегодня почти забыто. Её основа — «Персиня», а суффикс -ин указывает на принадлежность: «сын Персини» или «человек из семьи Персини».

Само слово «Персиня» — это, скорее всего, вариант имени Перфилий (от греческого Перфилиос — «порфирородный», то есть «рождённый в пурпуре»). В русских говорах имя Перфилий сокращали до Перша, Першата, а затем и до Персиня. Такое стяжение — обычное дело для народной речи: громоздкое церковное имя обкатывали до короткого и удобного бытового прозвища. Сын такого Персини и становился Персининым.

Менее вероятная, но возможная версия — связь со словом «перси» (устаревшее «грудь»). В этом случае прозвище Персиня могли дать человеку с мощной грудной клеткой, широкоплечему или даже тучному. Однако фамилии от названий частей тела встречаются реже, чем от имён, и обычно имеют более грубую, простонародную окраску. Версия с именем Перфилий выглядит правдоподобнее, тем более что в старых переписных книгах XVII–XVIII веков встречаются и Перфильевы, и Першины, и Персинины — все из одного гнезда.

Географически фамилия редкая. Основные очаги — центральные области России, особенно бывшие Владимирская и Нижегородская губернии. Встречается и на Урале, куда переселенцы принесли её в XVIII веке. В дворянских родословных Персинины не значатся — это крестьянская или мещанская фамилия, что подтверждается её словообразовательной моделью: суффикс -ин характерен для простонародных фамилий, образованных от личных имён и прозвищ, в отличие от фамилий на -ский у духовенства и дворян.

Таким образом, Персинин — это «сын Персини», а Персиня — сокращение от старинного имени Перфилий. Носитель фамилии, скорее всего, происходит из крестьянской среды центральной России, а его далёкий предок был человеком с не самым редким, но и не повсеместным именем, которое со временем стёрлось из обихода, оставшись только в фамилии.