Фамилия Пигалицин — один из тех случаев, когда прозвище предка оказалось прочнее крестильного имени. Её основа — не церковное, а народное слово «пигалица»: так в русских говорах называли чибиса, небольшую птицу из отряда ржанкообразных. Прозвище Пигалица мог получить человек за внешнее сходство — скажем, за длинноногость или сутулость, — либо за голос: чибис кричит резко и пронзительно. Но есть и другая, бытовая версия: в некоторых регионах «пигалицей» в переносном смысле называли невысокого, тщедушного или суетливого человека.

Модель образования фамилии проста и прозрачна. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Пигалицин — это «сын Пигалицы» или «человек из рода Пигалицы». Такая патронимическая модель в XVI–XVII веках была типична для недворянских сословий — крестьян, посадских людей, однодворцев. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от имён на согласный, -ин закреплялся за основами на -а/-я. Поэтому Пигалицин стоит в одном ряду с Птицыным, Сорокиным, Воробьёвым — фамилиями, ведущими начало от птичьих прозвищ.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южнорусским областям. Встречается она нечасто, что естественно для прозвища, не ставшего массовым. В дореволюционных переписях Пигалицины фиксировались в Тульской, Рязанской, Тамбовской губерниях — в зоне, где чибис был обычной полевой птицей, а местные говоры сохраняли слово «пигалица». Интересно, что в некоторых диалектах слово писалось через «е» — «пегалица», откуда мог возникнуть и вариант Пегалицин, но в официальных документах победила форма с «и».

Ударение в фамилии обычно падает на второй слог: Пигали́цин. Ошибочное произношение на первый слог встречается, но оно ломает ритм, заданный суффиксом -иц- в основе. Словообразовательно фамилия родственна более распространённой Пигалев, однако Пигалицин сохранила уменьшительно-пренебрежительный оттенок исходного прозвища — суффикс -иц- в русском языке часто придаёт слову оттенок мелкости или несерьёзности.

Сословных данных по фамилии немного, но судя по типу окончания и отсутствию дворянских гербов, Пигалицины относились к податным сословиям — государственным или помещичьим крестьянам. Известных исторических личностей с такой фамилией не зафиксировано, что типично для прозвищной фамилии локального бытования: она осталась в памяти нескольких родов, а не вышла на общерусскую сцену.