Фамилия Пигарин образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей — с помощью суффикса -ин, который присоединялся к основам, оканчивающимся на -а или -я. Такая модель указывает на принадлежность: Пигарь — это человек, а Пигарин — буквально «сын Пигаря» или «человек из рода Пигаря». Вопрос упирается в то, что скрывается за основой «Пигарь».

Здесь есть две основные версии, и обе имеют право на жизнь. Первая связывает прозвище Пигарь с профессией или ремеслом. В южнорусских и украинских говорах словом «пигарь» могли называть певчего, особенно того, кто поёт высоким, тонким голосом, почти писком. Это значение идёт от глагола «пигать» — пищать, издавать тонкие звуки. В таком случае предок носителя фамилии мог быть церковным певчим или просто обладателем характерного голоса, за что и получил прозвище.

Вторая версия — прозвище могло быть дано по схожести с птицей. В народе пигарём иногда называли чибиса или другую мелкую пищащую птицу. Такие «птичьи» прозвища были обычны для крестьян: человека могли прозвать Воробьём, Соловьём или Пигарём за подвижность, суетливость или особый говор.

Встречается и более прозаичное толкование: «пигарь» — это небольшой глиняный горшок или кувшин, но это значение менее распространено и скорее локально.

Фамилия Пигарин не относится к числу дворянских или широко известных — это типичная крестьянская или мещанская фамилия, закрепившаяся на юге России, в частности в Воронежской, Курской и Ростовской областях. Встречается она и на Украине, где могла писаться как Пігаренко или Пігарь. Интересно, что в некоторых переписях XIX века фигурирует форма Пигарев — с суффиксом -ев, что говорит о колебаниях в написании: основу могли воспринимать и как Пигарь, и как Пигара.

Таким образом, фамилия Пигарин, скорее всего, ведёт начало от прозвища, данного человеку с певческим голосом или схожестью с птицей. Это не редкая, но и не массовая фамилия, сохранившая память о живом народном слове, которое сегодня почти вышло из употребления.