Основой фамилии Пигаркин послужило мирское имя Пигарка. Пигарка - производная форма мирского имени Пигарь, данного по названию птицы. В некоторых диалектах пигарем называют хохлатого нырка. Давая младенцу такое имя, как Пигарь, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделена эта птица. Менее вероятно, что в основе фамилии Пигаркин лежит прозвище Пигарка. Пигаркой могли прозвать человека, чем-либо внешне или по поведению напоминавшего пигаря. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Пигарка, со временем получил фамилию Пигаркин.