Фамилия Пигин образована от личного прозвища, и это один из тех случаев, когда за привычным современным окончанием скрывается пласт диалектной лексики XV–XVI веков. Модель типична для русского севера и северо-востока: прозвищное имя на -а или -ун давало основу, к которой прибавлялся притяжательный суффикс -ин, отвечающий на вопрос «чей?». То есть Пигин буквально означает «сын Пиги», потомок человека по прозвищу Пига или Пигун.

Само прозвище Пигун, Пига не встречается в нарицательной лексике, но в памятниках северо-восточной Руси XV–XVI веков надежно зафиксированы сходные именования: Пигулька, Пигусь, Пигун. Это говорит о том, что перед нами не случайная ошибка письма, а живая, пусть и локальная, традиция именования. Наиболее вероятная связь этих прозвищ — с диалектным глаголом «пигалить», то есть «надоедать, докучать, клянчить». Тогда прозвище Пига или Пигун получал человек назойливый, приставучий, который постоянно чего-то выпрашивал и не давал покоя окружающим.

Есть и вторая версия, более мягкая по смыслу. Она выводит прозвище из слова «пигалица» — так в народе называют маленькую птичку (чибиса), а заодно и человека тщедушного, невысокого ростом и худощавого. В этом случае прозвище Пига работало бы как меткая бытовая характеристика внешности, а не характера. Обе гипотезы имеют право на существование, но первая выглядит предпочтительнее: глагольная основа «пигалить» объясняет появление целого гнезда однокоренных прозвищ (Пигулька, Пигусь, Пигун), тогда как версия с птичкой опирается на единичное слово.

Интересно, что фамилия не получила распространения в центральных регионах, что косвенно подтверждает её северное происхождение. О точном месте и времени возникновения фамилии Пигин говорить сложно: процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, и крестьянские фамилии нередко закреплялись лишь к XVII–XVIII векам. Тем не менее, сама фамилия сохранила для нас память о метком народном слове, которое иначе кануло бы в лету.