Основой фамилии Пикалкин послужило мирское имя Пикалка. Мирское имя Пикалка, вероятно, восходит к нарицательному «пикаль» в значении «мотылек, бабочка». Поэтому, давая младенцу такое имя, как Пикалка, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделён избранный представитель животного мира. Согласно другой гипотезе, фамилия Пикалкин произошла от прозвища Пикалка. Возможно, оно этимологически связано с глаголом «пикать», то есть «издавать писк». Согласно этому, можно предположить, что Пикалкой называли либо обладателя очень тонкого голоса, либо скотовода или пастуха. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Пикалка, со временем получил фамилию Пикалкин.