Фамилия Пилипишина образована от имени Пилипиша. Пилипиша — это украинская и белорусская форма крестильного мужского личного имени Филипп, которое в переводе с древнегреческого языка означает «любитель лошадей». Скорее всего, основатель рода Пилипишиных был выходцем из рабочей или крестьянской среды.