Имя Пилип представляет собой украинскую просторечную форму имени Филипп. В переводе с древнегреческого это имя означает «любитель лошадей», «любитель верховой езды». Скорее всего, основатель рода Пелипко был человеком из простого сословия. Поэтому Пилипко буквально понималось как «сын Пилипа». Также возможно, что суффикс -ко не является фамильным. В этом случае фамилия Пилипко образована от формы имени Филипп, непосредственно звучавшей как Пилипко.