Фамилия Пилипкин — редкий случай, когда корень почти не изменился, а суффикс чётко указывает на происхождение. В её основе лежит просторечная форма имени Филипп — Пилип. В русских говорах, особенно на юге и в центральных областях, начальное «ф» часто заменяли на «п», а безударное произношение давало «и» вместо «е»: так Филипп превращался в Пилипа. От этого имени образовали фамилию по самой распространённой модели: Пилип + суффикс принадлежности -ин. Суффикс -ин в русских фамилиях означает «чей?» — то есть Пилипкин буквально «сын Пилипа» или «человек из семьи Пилипа».

Интересно, что фамилия сохранила народную, нецерковную огласовку. В официальных документах, метрических книгах и ревизских сказках имя Филипп писали по-церковнославянски, с «ф». Но в быту, при записи крестьян или мещан, священники и писцы нередко фиксировали то, что слышали — Пилип. Поэтому Пилипкины — это потомки тех, кого в деревне звали Пилипом, а не Филиппом. Такая замена звука — признак давней, ещё допетровской традиции произношения.

По сословной принадлежности фамилия однозначно крестьянская или мещанская. Дворянских родов Пилипкиных не зафиксировано. Встречается она в основном в регионах, где было сильно влияние южнорусского говора: в Курской, Воронежской, Тамбовской, Рязанской губерниях. В XIX веке фамилия была редкой и локальной, не разбросанной по всей империи.

У фамилии есть однокоренные «собратья»: Пилипенко (украинский вариант), Пилипчук (западноукраинский), Пилипьев (более книжный, от полной формы). Но Пилипкин стоит особняком — он чисто русский по суффиксу, но с диалектным корнем. Если вы встретили Пилипкина за пределами чернозёмной полосы, скорее всего, его предки мигрировали оттуда в ходе столыпинских переселений или индустриализации.