Фамилия Пилипончик образована от аналогичного имени – краткой формы имени Пилипп. Оно в свою очередь представляет собой диалектную форму имени Филипп, означающего в переводе с древнегреческого языка означает «любитель лошадей». Чередование звуков «ф» и «п» в основе имени связано с особенностями фонетики древнерусского языка: ранее в русском языке не было звука «ф», поэтому часто в заимствованных словах на его заменяли звуком «п». Это имя принадлежало одному из двенадцати апостолов Филиппу. Оно проповедовал Евангелие в Скифии и Фригии и был распят в Иераполе Фригийском, расположенном в Малой Азии. Апостол Филипп считается покровителем Люксембурга, Уругвая и итальянских городов Неми и Фраскати.