Фамилия Пинкальская — редкий случай, когда географическая основа очевидна, а вот исходный топоним вызывает вопросы. Оканчивается фамилия на -ский, что почти всегда указывает на польское, белорусское или украинское происхождение, причем чаще всего дворянское или шляхетское: такую форму получали фамилии по названию имения или родового поместья. Пинкальская — это женская форма; мужская, соответственно, Пинкальский.

Корень фамилии — Пинкаль. Скорее всего, он восходит к названию населенного пункта. На карте Восточной Европы существует несколько мест с похожими названиями: например, деревня Пинкаль (Pinkał) в Польше, в Подляском воеводстве, или Пинкалишки в Литве. Фамилия могла образоваться от названия такого хутора или усадьбы. Менее вероятная, но тоже возможная версия — от прозвища Пинкаль, которое могло быть связано с диалектным словом «пинкать» (пинать, толкать) или с литовским pinkti (путать, мешать). Однако для фамилии на -ский прозвищная основа нетипична — такие фамилии почти всегда «географические».

Суффикс -ск- в сочетании с окончанием -ая — классическая модель для фамилий польской шляхты (ср. Замойская, Потоцкая). Если предки Пинкальских были шляхтичами, то фамилия закрепилась за ними после раздела Речи Посполитой, когда многие дворяне получили официальные фамилии по названиям своих имений. Если же фамилия крестьянская — а такое тоже бывает, особенно в XIX веке, — то она могла возникнуть, когда крестьянам давали фамилию по названию деревни, откуда они происходили.

В русском языке фамилия Пинкальская почти не встречается — это штучный случай, скорее всего, связанный с миграцией из западных губерний Российской империи (Виленской, Гродненской, Минской). В современных польских и литовских справочниках фамилия Пинкальский/Пинкальская тоже редкая, что подтверждает её локальный характер. Таким образом, носительница фамилии Пинкальская может с высокой вероятностью вести род из небольшого местечка на границе современной Польши, Беларуси и Литвы.