Фамилия Пинковский — типичный пример польской или западнорусской модели образования через суффикс -ский. Этот суффикс, как правило, указывает на дворянское или шляхетское происхождение: в Речи Посполитой фамилии на -ский носили землевладельцы, чьи родовые прозвища происходили от названия поместья. Пинковский — значит «тот, кто из Пинкова» или «владелец Пинкова».

Основа фамилии — топоним Пинков. Таких названий несколько: деревни Пинково встречаются в Беларуси (Витебская область) и на Украине (Волынь, Житомирщина). Название деревни, скорее всего, связано с рекой Пина (приток Припяти) или с городом Пинск. В пинских болотах и вокруг Пинска много географических названий с корнем «пин-», так что Пинковский может означать «выходец из окрестностей Пинска». Менее вероятно, но возможно, что в основе лежит прозвище Пинок, данное человеку за драчливость или резкий характер, но для фамилий на -ский такая бытовая основа нетипична.

В Российской империи фамилия Пинковский встречалась в основном среди православной и католической шляхты западных губерний, а также среди мещан и однодворцев, которые утратили дворянство, но сохранили фамилию. В советское время фамилия распространилась по всей стране, но её концентрация остаётся выше в Беларуси, на западе Украины и в соседних регионах России (Брянская, Смоленская области). Известных носителей, оставивших заметный след в истории, нет — фамилия остаётся локальной и негромкой.

Если сравнивать с однокоренными, то Пинский — более распространённый вариант, напрямую от города Пинск. Пинковский же указывает на меньший населённый пункт, что делает её более редкой и привязанной к конкретному родовому гнезду.