Фамилия Пинякшев образована от имени Пинякша — это нечастая и очень локальная модель, которая напрямую выводит нас в мордовскую (эрзянскую или мокшанскую) среду. В основе лежит личное имя Пинякша, которое, в свою очередь, является уменьшительно-ласкательной формой от более древнего имени Пинас. Корень здесь — мордовское слово «пине», то есть «собака».

Имя Пинас и его производные — это классический пример охранительных имён, которые были широко распространены у финно-угорских народов Поволжья. Смысл такого имянаречения прост и практичен: родители сознательно давали ребёнку «некрасивое» или «звериное» имя, чтобы обмануть злых духов. Считалось, что духи не позарятся на ребёнка с таким именем и не будут ему досаждать. Параллельно с этим существовало и другое, более позитивное пожелание: от собаки, как от существа, близкого к природе, к ребёнку должны были перейти её качества — выносливость, верность, чуткость и неприхотливость. То есть имя несло двойную функцию: защиту и пожелание нужных для жизни свойств.

Суффикс -ша в имени Пинякша — это типичный для мордовской традиции способ образования ласкательных и уменьшительных форм. Он смягчает исходную основу, делая имя более «домашним» и привычным в быту. От этой ласкательной формы и пошла фамилия.

Сама фамилия Пинякшев построена по стандартной русской модели притяжательных прилагательных с суффиксом -ев. Она отвечает на вопрос «чей?»: Пинякшев значит «сын Пинякши», «ребёнок Пинякши». Смена конечного «а» на «ев» в фамилии — это результат адаптации мордовского имени к русской грамматике: к основе на мягкий согласный (Пинякш-) добавился русский суффикс принадлежности.

Географически фамилия почти наверняка уходит корнями на территорию современной Мордовии или в соседние регионы — Нижегородскую, Пензенскую, Ульяновскую области, где исторически селились эрзя и мокша. В документах XVII—XIX веков мордовские крестьяне нередко фиксировались под такими «полуименами», а при переходе на постоянные фамилии в XIX веке эти формы закрепились и русифицировались.

Отдельно стоит сказать о родственных фамилиях. Пиняев, Пиняков, Пинягин — все они восходят к тому же корню «пине» (собака) и его производным формам. Встречается и фамилия Пинаев, которая ближе к исходному имени Пинас. На этом фоне Пинякшев выделяется тем, что сохранил самую редкую, ласкательную ветвь имени, которая в качестве фамилии почти не встречается за пределами своей исторической родины. Это делает фамилию не просто редкой, а очень точным маркером мордовского происхождения её первых носителей.