Фамилия Пищалин образована от прозвища Пищала — так в старых русских говорах называли крикливого, визгливого человека, того, кто говорит пронзительно и громко. Глагол «пищать» дал не только название оружия (пищаль), но и целое гнездо прозвищ для людей с резким, неприятным голосом. В этом смысле фамилия звучит нелестно, но в XV–XVII веках прозвища по свойствам характера или речи давали без злого умысла — просто как отличительный признак.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Пищалин буквально означает «сын или потомок Пищалы». Такая модель типична для северных и центральных областей России, особенно для Вологодчины, Архангельской и Костромской губерний, где фамилии на -ин встречаются чаще, чем на -ов. В этих краях прозвище Пищала могло закрепиться за родом ещё в допетровскую эпоху.

Возможна и вторая, более редкая версия: в некоторых диалектах «пищалой» называли не только человека, но и худую, тощую скотину или даже растение с тонким стеблем. Если прозвище дали крестьянину, державшему слабый скот или обрабатывавшему скудную землю, смысл меняется, но суффиксальная форма остаётся той же.

В письменных источниках фамилия встречается с XVII века. Например, в переписных книгах Соликамского уезда 1647 года упомянут крестьянин Васка Пищалин — одно из ранних документальных подтверждений. Позднее носители фамилии расселились по Уралу и Сибири, что связано с переселением крестьян в XVII–XIX веках. Среди современных Пищалиных преобладают жители Пермского края, Свердловской и Кировской областей.

Однокоренные фамилии — Пищалов, Пищаев, Пищальников — различаются суффиксами, но все восходят к той же основе «писк, визг». Интересно, что фамилия Пищалин не имеет отношения к оружию напрямую, хотя внешнее сходство с «пищалью» часто вводит в заблуждение. Прозвище старше, чем огнестрельное оружие в русском обиходе, и его корень чисто звукоподражательный.