Фамилия Плишков образована от прозвища или нецерковного имени Плишко. Основа здесь — корень «плиш-», который в русских говорах имеет несколько значений. Самое вероятное: «плиш» или «плишко» — это плешь, лысина, а также человек с лысиной. В диалектах слово «плиш» могло означать и «заплата», «лоскут», что тоже даёт понятную характеристику — либо бедняк в заплатанной одежде, либо портной. Но первая версия, связанная с внешностью, встречается в фамилиях чаще.

Фамилия построена по типичной восточнославянской модели: основа на -о (Плишко) плюс суффикс принадлежности -ов. То есть Плишков буквально означал «сын Плишка». Суффикс -ов указывает на русское происхождение, чаще всего из северных или центральных областей, где эта модель была основной.

Однокоренные фамилии встречаются: Плишкин (с другим патронимическим суффиксом -ин), Плишаков, Плишняк. В украинском и белорусском языках есть фамилия Плишко без суффикса — она сохранила исходную форму прозвища. Это говорит о том, что носители фамилии Плишков, вероятно, происходят из регионов, где русская модель на -ов вытеснила более раннюю бессуффиксную форму.

Фамилия редкая. В дореволюционных справочниках и переписях она не фиксируется массово. Наибольшая концентрация носителей сегодня — в южных областях России и в восточной Украине, что может указывать на миграцию крестьян в XIX веке.