Фамилия Подабукина — редкий случай, когда прозвище или имя-основа, скорее всего, не имеют ничего общего с тем, что лежит на поверхности. Интуитивно хочется разбить слово на «под» и «абука», но это ложный путь. На самом деле, в основе фамилии лежит имя Абука — уменьшительная или производная форма от канонического имени Аввакум (древнееврейское «обнимающий»). В народной речи имя Аввакум претерпело сильные сокращения: Абакум, Абукум, и, как следствие, Абука. Фамилия образована по типичной русской модели: к основе «Абук» добавился суффикс принадлежности -ин, указывающий на то, что предка звали Абука. Приставка По- в начале фамилии — это не предлог, а часть сложного русского прозвища, которое закрепилось в официальном родовом имени.

Приставка «по-» в фамилиях обычно указывает на пространственное или социальное положение: «тот, кто живет за (под) чем-то» или «тот, кто происходит от кого-то по какой-то линии». В данном случае, скорее всего, Подабука — это человек, который жил «под Абукой» (например, ниже по течению реки от селения Абукино, или в низине рядом с усадьбой человека по имени Абука). Либо же это указание на родство: «потомок Абуки по младшей линии». Такая модель (По- + имя + -ин) встречается реже, чем стандартные отчества, и часто фиксирует не прямого наследника, а человека, приписанного к чужому роду или живущего на земле, принадлежащей Абуке.

Географически фамилия Подабукина тяготеет к северным и центральным областям России, особенно к бассейну Северной Двины и Вологодчине, где имя Аввакум было чрезвычайно популярно благодаря старообрядчеству (протопоп Аввакум). В этих краях приставка «по-» в фамилиях — не редкость (сравните: Пономарёв, Потапов — там она часть корня, но есть и чистые примеры: Подушкин — «под ушкой», то есть у подножия холма). Таким образом, Подабукина — это не про «букварь» и не про «подобувание», а про человека, чей предок носил имя Аввакум в его простонародной форме Абука и, вероятно, жил в определенном пространственном отношении к нему.

С точки зрения словообразования, фамилия уникальна тем, что сохранила архаичную конструкцию с двумя аффиксами (приставка и суффикс), что делает её «живым ископаемым» русской антропонимии. Ударение, скорее всего, падает на третий слог: Подабу́кина. Это не фамилия дворянского рода (нет типичного -ский/-ской), а крестьянская или посадская, зафиксировавшая прозвище в документах XVII–XVIII веков, когда фамилии только начинали закрепляться у непривилегированных сословий.