Фамилия Подуначук — одна из тех, что сразу выдают географию своего происхождения: её основа напрямую связана с Дунаем. В отличие от привычных русских фамилий на -ов/-ев, здесь работает западноукраинская и белорусская модель с суффиксом -ук/-чук, который указывает на «сына» или «потомка». То есть Подуначук — это буквально «тот, кто с Дуная» или «сын того, кто живёт у Дуная».

Корень «Дунай» в фамилиях встречается нередко, но приставка «по-» уточняет положение: не сам Дунай, а пространство вдоль реки или рядом с ней. В говорах «подунайский» означало «придунайский», «живущий по Дунаю». Так что первый носитель фамилии, скорее всего, получил прозвище Подунай или Подунач за то, что его двор стоял на берегу этой реки или он переселился оттуда.

Суффикс -чук вместо -ук (Подуначук, а не Подунаюк) — это диалектная черта, характерная для юго-западных областей Украины, особенно для Подолья, Буковины и Прикарпатья. В этих краях фамилии на -чук — одни из самых распространённых, и их часто давали по месту жительства. Если бы фамилия возникла в центральной Украине, она звучала бы как Подунаенко, а в Польше — как Подунайский.

Сословно носители такой фамилии почти наверняка были крестьянами или мещанами. Дворянских родов Подуначук не зафиксировано — типичная народная фамилия, которая закрепилась в XIX веке при массовой паспортизации населения Австро-Венгерской империи, куда входили эти земли.

В написании фамилии возможны варианты: Подунайчук (через «й») или Подунащук (с упрощением). Но основная форма — Подуначук — сохраняет связь с исходным словом «Дунай» и прозрачную морфологию, что делает её этимологию одной из самых понятных среди украинских фамилий.