Фамилия Покидины образована от мирского имени или прозвища Покида, что ставит её в ряд древних славянских именований, возникших из нарицательных слов. Вопреки возможному ожиданию, смысл здесь не негативный. Основа связана с глаголом «покидать», но значение имени — обережное: так называли ребёнка в надежде, что он не будет покинутым, не останется сиротой. Подобная практика давать «защитные» имена была широко распространена на Руси.

Прямое письменное подтверждение существования основы находим в рязанских источниках конца XVI века: упоминается Покид Дмитриевич Кученев. Эта запись важна не только как раннее свидетельство, но и как указание на географию: корень фамилии бытовал в рязанских землях. Сама модель образования проста и типична для своего времени: суффикс -ин указывает на принадлежность потомку человека по имени Покида, то есть «Покидин» буквально означает «сын Покиды».

Стоит различать две версии происхождения: имя могли дать при рождении как пожелание, либо же прозвище Покида закрепилось за взрослым человеком по каким-то житейским обстоятельствам. Вторая версия менее вероятна, поскольку глагольная основа в прозвищах обычно отражала род занятий или яркую черту, а «покидать» для этого даёт мало оснований. Поэтому версия с охранительным именем выглядит убедительнее.

Точное время перехода имени в фамилию установить сложно — этот процесс растянулся на столетия и завершился в разных слоях общества не одновременно. Однако сам факт бытования фамилии в современности делает её живым памятником славянской культуры, сохранившим в себе отголосок древних верований и родительских надежд.