Фамилия Поликарина образована от мужского крестильного имени Поликарп, которое в переводе с греческого означает «многоплодный». В основу фамилии легла не полная, а производная, разговорная форма этого имени — Поликар. Такое сокращение характерно для простонародной среды: полные имена в быту часто усекали до более короткого и удобного в произношении варианта. Скорее всего, основатель рода Поликариных был человеком из простого сословия, где подобные формы имен были обычным делом.

Сама фамилия построена по типичной для русской ономастики модели: к основе Поликар добавляется притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность. Буквально Поликарина означает «дочь или жена Поликара», а для мужского варианта Поликарин — «сын Поликара». То есть изначально это было отчество, которое со временем закрепилось как родовое прозвание. Потомок человека по имени Поликар, отвечая на вопрос «чей ты?», говорил «Поликарин», и эта форма постепенно превратилась в наследственную фамилию.

Интересно, что фамилия с окончанием -ина встречается реже, чем более распространенные -ов и -ев. Это тоже косвенно говорит о народном, не книжном происхождении: в крестьянской и мещанской среде притяжательные формы на -ин были особенно популярны.