Фамилия Полубот — одна из тех, где прозвище и социальный статус слиты воедино. В её основе лежит украинское или южнорусское прозвище, связанное с казачьим бытом. «Полубот» — это человек, у которого «половина бота»: ботом на юге России и Украине называли лодку, челн, небольшое судно. Первый носитель такого прозвища, скорее всего, был бедным рыбаком или перевозчиком, владевшим не целой лодкой, а лишь долей в ней, либо ходившим на половинной, утлой лодчонке.

Словообразовательная модель проста: прозвище Полубот со временем закрепилось как фамилия без дополнительных суффиксов, что характерно для украинской ономастики. В русской среде фамилия могла обрасти суффиксом -ов, но в исходной форме Полубот встречается именно в украинских реестрах. Это не патроним (не «чей-то сын»), а прямое прозвище, перешедшее в фамилию.

Самая известная историческая фигура с такой фамилией — наказной гетман Войска Запорожского Павел Полуботок (ок. 1660–1723). Его фамилия — уменьшительная форма от Полубот: суффикс -ок указывал на молодого или незначительного владельца «полубота». Таким образом, фамилии Полубот и Полуботок — однокоренные, и вторая прямо отсылает к первой.

Малороссийское происхождение фамилии подтверждается и географией: подавляющее большинство носителей Полубот сегодня сосредоточено в центральных и восточных областях Украины, а также в приграничных регионах России — там, где исторически жили казаки и крестьяне, ходившие по Днепру и его притокам. Встречается она редко, что говорит о её локальном, гнездовом распространении.

Если ваш предок носил фамилию Полубот, он почти наверняка происходил из украинской или южнорусской среды, связанной с речным промыслом. Никакого боярского или дворянского корня здесь нет, и попытки возвести её к «полубоярину» или «полубогу» — народная этимология, не выдерживающая критики.