Фамилия Полухтин — яркий пример того, как прозвище, данное человеку несколько веков назад, превратилось в устойчивое родовое имя. В её основе лежит нецерковное имя или прозвище Полухта, которое в старину было вполне обычным. Это слово — живая народная переделка канонического имени Полиевкт (греч. «многославный»). В русском языке длинные и сложные для произношения имена часто укорачивали: Полиевкт превращался в Полуект, а затем и в Полухту — так удобнее было звать в быту.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русских фамилий: к основе Полухт- добавился патронимический суффикс -ин. Он указывал на принадлежность: «чей сын?» — «Полухтин», то есть сын Полухты. Такая модель характерна для фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на -а или -я (как Пушка — Пушкин, Илья — Ильин). Если бы в основе было имя Полухт (редкая мужская форма без окончания), фамилия звучала бы как Полухтов, но история закрепила именно вариант на -ин.

Географически фамилия Полухтин распространена в центральных и северных регионах России, особенно в бывших новгородских и вятских землях. Это косвенно подтверждает, что имя Полухта бытовало именно в этих краях. Предки современных Полухтиных, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми — в среде духовенства и дворянства имя Полиевкт чаще сохраняли в полной, церковной форме.

Стоит обратить внимание на редкий случай: в некоторых говорах слово «полухта» могло иметь и самостоятельное значение — так иногда называли неповоротливого или рассеянного человека. Однако это значение вторично и, скорее всего, возникло уже после того, как имя Полухта стало привычным, по народной этимологии. Основной и наиболее достоверной версией остаётся происхождение от крестильного имени Полиевкт через его разговорную форму.