Фамилия Полужанова — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все прочие версии. В основе лежит не имя и не ремесло, а топоним — название польского или белорусского местечка Полужаны. Такие села и хутора встречаются на территории современной Гродненской области Беларуси и в восточных воеводствах Польши. Корень названия, скорее всего, связан с диалектным словом «полуга» — низкое сырое место, луг у воды. То есть предок носителя фамилии был выходцем из деревни, стоявшей на сырой низине, и получил прозвище «Полужанин» — житель Полужан.

Суффикс -ов- в окончании фамилии (Полужанов) указывает на стандартную русскую модель притяжательности: «чей?» — Полужанова. Это могло означать сына Полужана, но, учитывая, что «Полужан» как личное имя или прозвище не зафиксировано, версия с названием местности выглядит убедительнее. Фамилия могла возникнуть уже после переселения семьи в великорусские губернии, когда прозвище «Полужанин» адаптировали под привычную форму на -ов.

Вторая, менее вероятная версия, выводит фамилию из прозвища «Полужан» — человека, который «полужит», то есть живёт наполовину, не в полную силу, возможно, ленивого или больного. Но для этой гипотезы нет надёжных диалектных подтверждений, и она уступает топонимической по степени правдоподобия.

Фамилия не относится к числу распространённых. Встречается в основном в центральных областях России, куда потомки выходцев из западных земель могли переселиться в XVII–XIX веках. Сословная принадлежность носителей не прослеживается — Полужановы могли быть и крестьянами, и мещанами, и однодворцами. Важная деталь: ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог — Полу́жанова, что дополнительно указывает на польско-белорусское происхождение основы, где ударение часто смещено относительно русских норм.